Прошло два года после смерти Эцио Аудиторе да Фиренце. От великого наследия осталось очень многое - он восстановил Братство, смог укрепить его позиции во всех городах мира. Теперь  длань Братства простиралась от Франции до Китая и от Турции до заснеженного Русского государства. Но после этого всего все наследство достаётся племяннице Эцио – Бьянке Аудиторе, дочери Клаудии. Но тамплиеры не дремлют. Они начинают возрождать свои базы в мире и новый предводитель ордена готовит наступление на своих врагов. Они вооружают солдат, набирают сторонников, пытаются пере вербовать ассасинов. Но не выходит… Пока.
А тем временем слышен отголосок прошлого, некий ассасин, наконец, вернувшийся с задания со странной картой в руках умирает рядом с разрушенной виллой Аудиторе.
Карту заполучили ассасины и пытаются найти еще одну частицу оставленную Предтечами.